Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNP16150 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNP16150 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNP16150 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPNP16150 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNP16150 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNP16150 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNP16150 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNP16150 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNP16150 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPNP16150 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPNP16150 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPNP16150 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNP16150 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPNP16150 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNP16150 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNP16150 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNP16150 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNP16150 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNP16150 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPNP16150 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPNP16150 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPNP16150 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPNP16150 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPNP16150 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNP16150 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNP16150 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNP16150 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNP16150 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNP16150 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNP16150 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPNP16150 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPNP16150 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPNP16150 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPNP16150 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPNP16150 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNP16150 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNP16150 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNP16150 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNP16150 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNP16150 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNP16150 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNP16150 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNP16150 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNP16150 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNP16150 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPNP16150 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPNP16150 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNP16150 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNP16150 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNP16150 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNP16150 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNP16150 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNP16150 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNP16150 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNP16150 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNP16150 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNP16150 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNP16150 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNP16150 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNP16150 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNP16150 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNP16150 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNP16150 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPNP16150 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms