Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ITGB4P16144 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITGB4P16144 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGB4P16144 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGB4P16144 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
ITGB4P16144 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ITGB4P16144 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms