Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAG1P15918 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAG1P15918 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAG1P15918 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAG1P15918 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAG1P15918 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAG1P15918 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RAG1P15918 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAG1P15918 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAG1P15918 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAG1P15918 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAG1P15918 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAG1P15918 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAG1P15918 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAG1P15918 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAG1P15918 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAG1P15918 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAG1P15918 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAG1P15918 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAG1P15918 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAG1P15918 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAG1P15918 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAG1P15918 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAG1P15918 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAG1P15918 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAG1P15918 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAG1P15918 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAG1P15918 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAG1P15918 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAG1P15918 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAG1P15918 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAG1P15918 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAG1P15918 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAG1P15918 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAG1P15918 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAG1P15918 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAG1P15918 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAG1P15918 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAG1P15918 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAG1P15918 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAG1P15918 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAG1P15918 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAG1P15918 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAG1P15918 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAG1P15918 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAG1P15918 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAG1P15918 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAG1P15918 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAG1P15918 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAG1P15918 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAG1P15918 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAG1P15918 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAG1P15918 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAG1P15918 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAG1P15918 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAG1P15918 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAG1P15918 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAG1P15918 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAG1P15918 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAG1P15918 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAG1P15918 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAG1P15918 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAG1P15918 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAG1P15918 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms