Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2F2P13984 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2F2P13984 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2F2P13984 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2F2P13984 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms