Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRFP10586 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRFP10586 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRFP10586 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRFP10586 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRFP10586 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms