Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM6P0DI80 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM6P0DI80 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM6P0DI80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM6P0DI80 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms