Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTMAP06454 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTMAP06454 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTMAP06454 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTMAP06454 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTMAP06454 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTMAP06454 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTMAP06454 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTMAP06454 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTMAP06454 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTMAP06454 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTMAP06454 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTMAP06454 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTMAP06454 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTMAP06454 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTMAP06454 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTMAP06454 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTMAP06454 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTMAP06454 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTMAP06454 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTMAP06454 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTMAP06454 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTMAP06454 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTMAP06454 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTMAP06454 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTMAP06454 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTMAP06454 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTMAP06454 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTMAP06454 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTMAP06454 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTMAP06454 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTMAP06454 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTMAP06454 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTMAP06454 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTMAP06454 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTMAP06454 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTMAP06454 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTMAP06454 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTMAP06454 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTMAP06454 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTMAP06454 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTMAP06454 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTMAP06454 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTMAP06454 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTMAP06454 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTMAP06454 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTMAP06454 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTMAP06454 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTMAP06454 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTMAP06454 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTMAP06454 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTMAP06454 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTMAP06454 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTMAP06454 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTMAP06454 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTMAP06454 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTMAP06454 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTMAP06454 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PTMAP06454 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTMAP06454 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTMAP06454 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTMAP06454 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTMAP06454 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTMAP06454 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTMAP06454 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTMAP06454 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTMAP06454 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTMAP06454 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTMAP06454 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTMAP06454 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTMAP06454 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms