Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS2P2O95744 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMS2P2O95744 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMS2P2O95744 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMS2P2O95744 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P2O95744 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P2O95744 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms