Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM37O94972 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRIM37O94972 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRIM37O94972 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM37O94972 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM37O94972 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms