Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF9O75901 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF9O75901 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF9O75901 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms