Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRPA1O75762 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRPA1O75762 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRPA1O75762 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPA1O75762 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRPA1O75762 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPA1O75762 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRPA1O75762 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms