Protein–RNA interactions for Protein: O75691

UTP20, Small subunit processome component 20 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP20O75691 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP20O75691 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP20O75691 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UTP20O75691 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UTP20O75691 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP20O75691 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP20O75691 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP20O75691 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP20O75691 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UTP20O75691 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP20O75691 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP20O75691 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP20O75691 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP20O75691 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTP20O75691 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTP20O75691 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP20O75691 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP20O75691 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP20O75691 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP20O75691 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP20O75691 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP20O75691 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP20O75691 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP20O75691 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP20O75691 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP20O75691 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP20O75691 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTP20O75691 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTP20O75691 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTP20O75691 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP20O75691 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP20O75691 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP20O75691 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP20O75691 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP20O75691 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP20O75691 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP20O75691 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP20O75691 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP20O75691 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP20O75691 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP20O75691 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP20O75691 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP20O75691 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP20O75691 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP20O75691 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP20O75691 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP20O75691 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP20O75691 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP20O75691 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP20O75691 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP20O75691 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP20O75691 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP20O75691 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP20O75691 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms