Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1BO75688 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1BO75688 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1BO75688 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPM1BO75688 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms