Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC4O75487 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC4O75487 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC4O75487 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC4O75487 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC4O75487 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC4O75487 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC4O75487 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC4O75487 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC4O75487 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC4O75487 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC4O75487 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC4O75487 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC4O75487 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC4O75487 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC4O75487 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC4O75487 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC4O75487 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC4O75487 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC4O75487 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC4O75487 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC4O75487 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC4O75487 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC4O75487 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC4O75487 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC4O75487 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC4O75487 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC4O75487 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC4O75487 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC4O75487 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC4O75487 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC4O75487 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC4O75487 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC4O75487 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC4O75487 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC4O75487 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC4O75487 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC4O75487 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC4O75487 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC4O75487 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC4O75487 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC4O75487 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC4O75487 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC4O75487 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC4O75487 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC4O75487 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC4O75487 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC4O75487 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC4O75487 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC4O75487 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC4O75487 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC4O75487 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC4O75487 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC4O75487 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC4O75487 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC4O75487 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC4O75487 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC4O75487 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC4O75487 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC4O75487 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC4O75487 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC4O75487 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC4O75487 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC4O75487 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC4O75487 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC4O75487 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC4O75487 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC4O75487 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC4O75487 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC4O75487 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC4O75487 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC4O75487 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC4O75487 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC4O75487 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms