Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG13O75143 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG13O75143 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG13O75143 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG13O75143 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG13O75143 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG13O75143 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG13O75143 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG13O75143 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG13O75143 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG13O75143 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG13O75143 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG13O75143 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG13O75143 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG13O75143 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG13O75143 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG13O75143 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG13O75143 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG13O75143 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG13O75143 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG13O75143 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG13O75143 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG13O75143 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG13O75143 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG13O75143 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG13O75143 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG13O75143 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG13O75143 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG13O75143 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG13O75143 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG13O75143 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG13O75143 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG13O75143 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG13O75143 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG13O75143 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG13O75143 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG13O75143 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG13O75143 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG13O75143 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG13O75143 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG13O75143 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG13O75143 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG13O75143 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG13O75143 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG13O75143 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG13O75143 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG13O75143 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG13O75143 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG13O75143 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG13O75143 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG13O75143 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG13O75143 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG13O75143 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG13O75143 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG13O75143 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG13O75143 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG13O75143 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG13O75143 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG13O75143 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG13O75143 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms