Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
N4BP1O75113 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
N4BP1O75113 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP1O75113 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP1O75113 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP1O75113 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP1O75113 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP1O75113 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP1O75113 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP1O75113 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP1O75113 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP1O75113 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP1O75113 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP1O75113 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP1O75113 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.54■■■□□ 2
N4BP1O75113 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP1O75113 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP1O75113 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP1O75113 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP1O75113 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
N4BP1O75113 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms