Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF2O60811 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF2O60811 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF2O60811 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF2O60811 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms