Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM1AO60341 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1AO60341 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM1AO60341 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1AO60341 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1AO60341 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms