Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRICKLE3O43900 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRICKLE3O43900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRICKLE3O43900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRICKLE3O43900 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRICKLE3O43900 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms