Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA2O43364 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXA2O43364 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA2O43364 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA2O43364 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA2O43364 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms