Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFS4O43181 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDUFS4O43181 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFS4O43181 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFS4O43181 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFS4O43181 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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