Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
POLR3AO14802 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
POLR3AO14802 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
POLR3AO14802 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
POLR3AO14802 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
POLR3AO14802 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLR3AO14802 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLR3AO14802 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
POLR3AO14802 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLR3AO14802 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms