Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8VVB4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8VVB4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8VVB4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8VVB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8VVB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8VVB4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8VVB4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8VVB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8VVB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
F8VVB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8VVB4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8VVB4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
F8VVB4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8VVB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8VVB4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8VVB4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8VVB4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8VVB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8VVB4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8VVB4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8VVB4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8VVB4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8VVB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8VVB4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8VVB4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8VVB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8VVB4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8VVB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
F8VVB4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8VVB4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8VVB4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8VVB4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8VVB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8VVB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8VVB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8VVB4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8VVB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8VVB4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8VVB4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8VVB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8VVB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
F8VVB4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
F8VVB4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8VVB4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8VVB4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8VVB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8VVB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8VVB4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8VVB4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8VVB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8VVB4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8VVB4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8VVB4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
F8VVB4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8VVB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8VVB4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F8VVB4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
F8VVB4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
F8VVB4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8VVB4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8VVB4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8VVB4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8VVB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F8VVB4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms