Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRBOX1C9JBD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRBOX1C9JBD0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRBOX1C9JBD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRBOX1C9JBD0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRBOX1C9JBD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRBOX1C9JBD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms