Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN24A6NM45 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN24A6NM45 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN24A6NM45 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN24A6NM45 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN24A6NM45 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN24A6NM45 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN24A6NM45 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN24A6NM45 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN24A6NM45 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN24A6NM45 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms