Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC154A6NI56 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC154A6NI56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC154A6NI56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC154A6NI56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms