Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBAL3A6NHL2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBAL3A6NHL2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBAL3A6NHL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms