Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRR23AA6NEV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRR23AA6NEV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRR23AA6NEV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRR23AA6NEV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms