Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEIS3P1A6NDR6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MEIS3P1A6NDR6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEIS3P1A6NDR6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms