Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC35F4A4IF30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC35F4A4IF30 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms