Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBASA2RRP1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBASA2RRP1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBASA2RRP1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBASA2RRP1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms