Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPAARA0A1B0GVQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPAARA0A1B0GVQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPAARA0A1B0GVQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPAARA0A1B0GVQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms