Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A0J9YXV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0J9YXV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms