Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBV2A0A0J9YWF9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV2A0A0J9YWF9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV2A0A0J9YWF9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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