RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572932.1

NOMO3-209, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-209ENST00000572932 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NOMO3-209ENST00000572932 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.06■□□□□ 0.96
NOMO3-209ENST00000572932 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.52■□□□□ 0.88
NOMO3-209ENST00000572932 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.59■□□□□ 0.57
NOMO3-209ENST00000572932 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NOMO3-209ENST00000572932 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
NOMO3-209ENST00000572932 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
NOMO3-209ENST00000572932 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.55■□□□□ 0.4
NOMO3-209ENST00000572932 ABCC9O60706 1549 aa17.52■□□□□ 0.4
NOMO3-209ENST00000572932 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.45■□□□□ 0.38
NOMO3-209ENST00000572932 NACADO15069 1562 aa17.31■□□□□ 0.36
NOMO3-209ENST00000572932 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.18■□□□□ 0.34
NOMO3-209ENST00000572932 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.1■□□□□ 0.33
NOMO3-209ENST00000572932 SCRIBQ14160 1630 aa16.88■□□□□ 0.29
NOMO3-209ENST00000572932 FOXD1Q16676 465 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-209ENST00000572932 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.78■□□□□ 0.28
NOMO3-209ENST00000572932 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.76■□□□□ 0.27
NOMO3-209ENST00000572932 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.65■□□□□ 0.26
NOMO3-209ENST00000572932 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.54■□□□□ 0.24
NOMO3-209ENST00000572932 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
NOMO3-209ENST00000572932 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
NOMO3-209ENST00000572932 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.29■□□□□ 0.2
NOMO3-209ENST00000572932 SMARCA4P51532 1647 aa16.25■□□□□ 0.19
NOMO3-209ENST00000572932 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.21■□□□□ 0.19
NOMO3-209ENST00000572932 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
NOMO3-209ENST00000572932 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
NOMO3-209ENST00000572932 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.15■□□□□ 0.18
NOMO3-209ENST00000572932 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-209ENST00000572932 WIZO95785 1651 aa16.05■□□□□ 0.16
NOMO3-209ENST00000572932 SMARCA2P51531 1590 aa16.04■□□□□ 0.16
NOMO3-209ENST00000572932 ADRA2BP18089 450 aa16.01■□□□□ 0.15
NOMO3-209ENST00000572932 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.01■□□□□ 0.15
NOMO3-209ENST00000572932 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NOMO3-209ENST00000572932 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NOMO3-209ENST00000572932 HMGXB3Q12766 1538 aa15.97■□□□□ 0.15
NOMO3-209ENST00000572932 NCAPD3P42695 1498 aa15.94■□□□□ 0.14
NOMO3-209ENST00000572932 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.94■□□□□ 0.14
NOMO3-209ENST00000572932 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NOMO3-209ENST00000572932 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NOMO3-209ENST00000572932 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.71■□□□□ 0.11
NOMO3-209ENST00000572932 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.63■□□□□ 0.09
NOMO3-209ENST00000572932 CFTRP13569 1480 aa15.52■□□□□ 0.07
NOMO3-209ENST00000572932 PRDM2Q13029 1718 aa15.48■□□□□ 0.07
NOMO3-209ENST00000572932 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.46■□□□□ 0.07
NOMO3-209ENST00000572932 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.45■□□□□ 0.06
NOMO3-209ENST00000572932 MSH5O43196 834 aa15.44■□□□□ 0.06
NOMO3-209ENST00000572932 NESP48681 1621 aa15.32■□□□□ 0.04
NOMO3-209ENST00000572932 ABCC8Q09428 1581 aa15.28■□□□□ 0.04
NOMO3-209ENST00000572932 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.28■□□□□ 0.04
NOMO3-209ENST00000572932 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.28■□□□□ 0.04
NOMO3-209ENST00000572932 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
NOMO3-209ENST00000572932 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.25■□□□□ 0.03
NOMO3-209ENST00000572932 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.24■□□□□ 0.03
NOMO3-209ENST00000572932 TOP2BQ02880 1626 aa15.23■□□□□ 0.03
NOMO3-209ENST00000572932 SYNJ1O43426 1573 aa15.23■□□□□ 0.03
NOMO3-209ENST00000572932 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.21■□□□□ 0.03
NOMO3-209ENST00000572932 CUX1P39880 1505 aa15.2■□□□□ 0.02
NOMO3-209ENST00000572932 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.18■□□□□ 0.02
NOMO3-209ENST00000572932 TRIM41Q8WV44 630 aa15.13■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.13■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.13■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 TOPBP1Q92547 1522 aa15.12■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 WDR62O43379 1518 aa15.09■□□□□ 0.01
NOMO3-209ENST00000572932 ERCC6Q03468 1493 aa15.07■□□□□ 0
NOMO3-209ENST00000572932 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.05■□□□□ -0
NOMO3-209ENST00000572932 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
NOMO3-209ENST00000572932 EEA1Q15075 1411 aa15.01□□□□□ -0.01
NOMO3-209ENST00000572932 WDR97A6NE52 1622 aa14.99□□□□□ -0.01
NOMO3-209ENST00000572932 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.97□□□□□ -0.01
NOMO3-209ENST00000572932 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NOMO3-209ENST00000572932 CUX2O14529 1486 aa14.93□□□□□ -0.02
NOMO3-209ENST00000572932 SOGA1O94964 1423 aa14.92□□□□□ -0.02
NOMO3-209ENST00000572932 IFT140Q96RY7 1462 aa14.9□□□□□ -0.02
NOMO3-209ENST00000572932 KIF27Q86VH2 1401 aa14.9□□□□□ -0.02
NOMO3-209ENST00000572932 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.89□□□□□ -0.03
NOMO3-209ENST00000572932 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.89□□□□□ -0.03
NOMO3-209ENST00000572932 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.87□□□□□ -0.03
NOMO3-209ENST00000572932 KIF21BO75037 1637 aa14.83□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.81□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 PRXQ9BXM0 1461 aa14.79□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 CUL7Q14999 1698 aa14.78□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.78□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.78□□□□□ -0.04
NOMO3-209ENST00000572932 PBRM1Q86U86 1689 aa14.76□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 IGF1RP08069 1367 aa14.75□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 GOLGA3Q08378 1498 aa14.74□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 GRIN2BQ13224 1484 aa14.73□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 ADAMTS12P58397 1594 aa14.71□□□□□ -0.05
NOMO3-209ENST00000572932 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
NOMO3-209ENST00000572932 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.68□□□□□ -0.06
NOMO3-209ENST00000572932 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.67□□□□□ -0.06
NOMO3-209ENST00000572932 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NOMO3-209ENST00000572932 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.66□□□□□ -0.06
NOMO3-209ENST00000572932 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 247.3 ms