RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558696.1

PCSK6-AS1-201, PCSK6 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PCSK6-AS1, Length 639 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.84■□□□□ 0.45
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.33■□□□□ 0.37
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.04■□□□□ 0.32
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.98■□□□□ 0.31
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.54■□□□□ 0.24
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.52■□□□□ 0.24
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.07■□□□□ 0.16
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CUX2O14529 1486 aa16.04■□□□□ 0.16
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.03■□□□□ 0.16
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 ERCC6Q03468 1493 aa15.91■□□□□ 0.14
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 SCRIBQ14160 1630 aa15.84■□□□□ 0.13
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.15■□□□□ 0.02
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.08■□□□□ 0
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 SMARCA4P51532 1647 aa14.96□□□□□ -0.01
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 ARHGEF11O15085 1522 aa14.94□□□□□ -0.02
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.89□□□□□ -0.03
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.89□□□□□ -0.03
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.84□□□□□ -0.03
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.74□□□□□ -0.05
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.74□□□□□ -0.05
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 ARAP1Q96P48 1450 aa14.72□□□□□ -0.05
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.65□□□□□ -0.06
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 FBLN2P98095 1184 aa14.65□□□□□ -0.06
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PCSK6-AS1-201ENST00000558696 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.6□□□□□ -0.07
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 IFT140Q96RY7 1462 aa14.56□□□□□ -0.08
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CHD1O14646 1710 aa14.54□□□□□ -0.08
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 KCNA4P22459 653 aa14.53□□□□□ -0.08
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.49□□□□□ -0.09
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CFTRP13569 1480 aa14.49□□□□□ -0.09
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 MYT1Q01538 1121 aa14.46□□□□□ -0.09
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 WIZO95785 1651 aa14.4□□□□□ -0.1
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.4□□□□□ -0.1
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.39□□□□□ -0.11
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 EEA1Q15075 1411 aa14.37□□□□□ -0.11
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.35□□□□□ -0.11
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 TOPBP1Q92547 1522 aa14.33□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.3□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 SYNJ1O43426 1573 aa14.3□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.29□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.29□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 ABCC8Q09428 1581 aa14.27□□□□□ -0.12
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 PRDM2Q13029 1718 aa14.27□□□□□ -0.13
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PCSK6-AS1-201ENST00000558696 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
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