RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505918.5

ZBED3-AS1-204, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene ZBED3-AS1, Length 568 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.36■□□□□ 0.05
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.22□□□□□ -0.29
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.61□□□□□ -0.39
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.57□□□□□ -0.4
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.52□□□□□ -0.41
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.34□□□□□ -0.43
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 NACADO15069 1562 aa12.31□□□□□ -0.44
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ABCC9O60706 1549 aa12.16□□□□□ -0.46
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SCRIBQ14160 1630 aa12.11□□□□□ -0.47
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.09□□□□□ -0.47
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.83□□□□□ -0.52
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.81□□□□□ -0.52
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TRIM41Q8WV44 630 aa11.7□□□□□ -0.54
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SMARCA4P51532 1647 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 WIZO95785 1651 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.54□□□□□ -0.56
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.53□□□□□ -0.56
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SMARCA2P51531 1590 aa11.53□□□□□ -0.56
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.51□□□□□ -0.57
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 EEA1Q15075 1411 aa11.48□□□□□ -0.57
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.48□□□□□ -0.57
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 HRCP23327 699 aa11.39□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 NCAPD3P42695 1498 aa11.38□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 HMGXB3Q12766 1538 aa11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.3□□□□□ -0.6
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.29□□□□□ -0.6
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ABCC8Q09428 1581 aa11.29□□□□□ -0.6
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 GOLGA3Q08378 1498 aa11.25□□□□□ -0.61
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SOGA1O94964 1423 aa11.22□□□□□ -0.61
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.22□□□□□ -0.61
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CFTRP13569 1480 aa11.19□□□□□ -0.62
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CEP162Q5TB80 1403 aa11.18□□□□□ -0.62
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TOP2BQ02880 1626 aa11.17□□□□□ -0.62
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 SYNJ1O43426 1573 aa11.16□□□□□ -0.62
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 KIF21BO75037 1637 aa11.16□□□□□ -0.62
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.12□□□□□ -0.63
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.11□□□□□ -0.63
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.09□□□□□ -0.63
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.09□□□□□ -0.63
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 KIF27Q86VH2 1401 aa11.09□□□□□ -0.63
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.08□□□□□ -0.64
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PRXQ9BXM0 1461 aa11.06□□□□□ -0.64
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CLIP1P30622 1438 aa11.05□□□□□ -0.64
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CUX1P39880 1505 aa11.03□□□□□ -0.64
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.01□□□□□ -0.65
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11□□□□□ -0.65
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11□□□□□ -0.65
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 APLP2Q06481 763 aa10.99□□□□□ -0.65
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.98□□□□□ -0.65
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PRDM2Q13029 1718 aa10.97□□□□□ -0.65
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.93□□□□□ -0.66
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CUX2O14529 1486 aa10.91□□□□□ -0.66
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 IGF1RP08069 1367 aa10.9□□□□□ -0.66
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.9□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.89□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.89□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.88□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.88□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.87□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ARAP1Q96P48 1450 aa10.84□□□□□ -0.67
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 MAP3K1Q13233 1512 aa10.83□□□□□ -0.68
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TOPBP1Q92547 1522 aa10.83□□□□□ -0.68
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.81□□□□□ -0.68
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.8□□□□□ -0.68
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.79□□□□□ -0.68
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CUL7Q14999 1698 aa10.76□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.75□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 NESP48681 1621 aa10.73□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.72□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.7□□□□□ -0.7
ZBED3-AS1-204ENST00000505918 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms