RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.65■■■■□ 3.3
SYP-208ENST00000494396 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31■■■□□ 2.55
SYP-208ENST00000494396 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SYP-208ENST00000494396 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.47■■■□□ 2.31
SYP-208ENST00000494396 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.46■■■□□ 2.31
SYP-208ENST00000494396 ABCC9O60706 1549 aa29.22■■■□□ 2.27
SYP-208ENST00000494396 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.21■■■□□ 2.27
SYP-208ENST00000494396 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.07■■■□□ 2.24
SYP-208ENST00000494396 NACADO15069 1562 aa28.86■■■□□ 2.21
SYP-208ENST00000494396 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.58■■■□□ 2.17
SYP-208ENST00000494396 SCRIBQ14160 1630 aa28.55■■■□□ 2.16
SYP-208ENST00000494396 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SYP-208ENST00000494396 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.95■■■□□ 2.07
SYP-208ENST00000494396 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
SYP-208ENST00000494396 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.69■■■□□ 2.02
SYP-208ENST00000494396 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.69■■■□□ 2.02
SYP-208ENST00000494396 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
SYP-208ENST00000494396 HRCP23327 699 aa27.58■■■□□ 2.01
SYP-208ENST00000494396 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.55■■■□□ 2
SYP-208ENST00000494396 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SYP-208ENST00000494396 SMARCA4P51532 1647 aa27.37■■□□□ 1.97
SYP-208ENST00000494396 WIZO95785 1651 aa27.31■■□□□ 1.96
SYP-208ENST00000494396 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.26■■□□□ 1.95
SYP-208ENST00000494396 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SYP-208ENST00000494396 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.02■■□□□ 1.92
SYP-208ENST00000494396 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.9■■□□□ 1.9
SYP-208ENST00000494396 SMARCA2P51531 1590 aa26.89■■□□□ 1.9
SYP-208ENST00000494396 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SYP-208ENST00000494396 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.86■■□□□ 1.89
SYP-208ENST00000494396 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.79■■□□□ 1.88
SYP-208ENST00000494396 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SYP-208ENST00000494396 NCAPD3P42695 1498 aa26.64■■□□□ 1.86
SYP-208ENST00000494396 HMGXB3Q12766 1538 aa26.61■■□□□ 1.85
SYP-208ENST00000494396 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SYP-208ENST00000494396 TRIM41Q8WV44 630 aa26.51■■□□□ 1.83
SYP-208ENST00000494396 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYP-208ENST00000494396 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SYP-208ENST00000494396 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.43■■□□□ 1.82
SYP-208ENST00000494396 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SYP-208ENST00000494396 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.28■■□□□ 1.8
SYP-208ENST00000494396 ABCC8Q09428 1581 aa26.26■■□□□ 1.79
SYP-208ENST00000494396 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
SYP-208ENST00000494396 CFTRP13569 1480 aa26.1■■□□□ 1.77
SYP-208ENST00000494396 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SYP-208ENST00000494396 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.99■■□□□ 1.75
SYP-208ENST00000494396 SYNJ1O43426 1573 aa25.96■■□□□ 1.75
SYP-208ENST00000494396 PRDM2Q13029 1718 aa25.91■■□□□ 1.74
SYP-208ENST00000494396 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-208ENST00000494396 SOGA1O94964 1423 aa25.82■■□□□ 1.72
SYP-208ENST00000494396 EEA1Q15075 1411 aa25.81■■□□□ 1.72
SYP-208ENST00000494396 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.8■■□□□ 1.72
SYP-208ENST00000494396 CUX1P39880 1505 aa25.75■■□□□ 1.71
SYP-208ENST00000494396 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.72■■□□□ 1.71
SYP-208ENST00000494396 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.71■■□□□ 1.71
SYP-208ENST00000494396 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SYP-208ENST00000494396 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.7■■□□□ 1.7
SYP-208ENST00000494396 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.7■■□□□ 1.7
SYP-208ENST00000494396 NESP48681 1621 aa25.69■■□□□ 1.7
SYP-208ENST00000494396 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.69■■□□□ 1.7
SYP-208ENST00000494396 MYT1Q01538 1121 aa25.67■■□□□ 1.7
SYP-208ENST00000494396 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.67■■□□□ 1.7
SYP-208ENST00000494396 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.54■■□□□ 1.68
SYP-208ENST00000494396 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.52■■□□□ 1.68
SYP-208ENST00000494396 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.47■■□□□ 1.67
SYP-208ENST00000494396 GOLGA3Q08378 1498 aa25.46■■□□□ 1.67
SYP-208ENST00000494396 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.46■■□□□ 1.67
SYP-208ENST00000494396 KIF27Q86VH2 1401 aa25.44■■□□□ 1.66
SYP-208ENST00000494396 KIF21BO75037 1637 aa25.44■■□□□ 1.66
SYP-208ENST00000494396 TOPBP1Q92547 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
SYP-208ENST00000494396 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.41■■□□□ 1.66
SYP-208ENST00000494396 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SYP-208ENST00000494396 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SYP-208ENST00000494396 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.36■■□□□ 1.65
SYP-208ENST00000494396 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYP-208ENST00000494396 CUX2O14529 1486 aa25.34■■□□□ 1.65
SYP-208ENST00000494396 CEP162Q5TB80 1403 aa25.33■■□□□ 1.65
SYP-208ENST00000494396 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYP-208ENST00000494396 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
SYP-208ENST00000494396 PRXQ9BXM0 1461 aa25.28■■□□□ 1.64
SYP-208ENST00000494396 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYP-208ENST00000494396 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.25■■□□□ 1.63
SYP-208ENST00000494396 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.23■■□□□ 1.63
SYP-208ENST00000494396 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.23■■□□□ 1.63
SYP-208ENST00000494396 IGF1RP08069 1367 aa25.19■■□□□ 1.62
SYP-208ENST00000494396 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.18■■□□□ 1.62
SYP-208ENST00000494396 NEUROD1Q13562 356 aa25.11■■□□□ 1.61
SYP-208ENST00000494396 WDR97A6NE52 1622 aa25.09■■□□□ 1.61
SYP-208ENST00000494396 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SYP-208ENST00000494396 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.08■■□□□ 1.6
SYP-208ENST00000494396 CLIP1P30622 1438 aa25.07■■□□□ 1.6
SYP-208ENST00000494396 ERCC6Q03468 1493 aa25.06■■□□□ 1.6
SYP-208ENST00000494396 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SYP-208ENST00000494396 WDR62O43379 1518 aa25.03■■□□□ 1.6
SYP-208ENST00000494396 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SYP-208ENST00000494396 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25■■□□□ 1.59
SYP-208ENST00000494396 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SYP-208ENST00000494396 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.98■■□□□ 1.59
SYP-208ENST00000494396 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.97■■□□□ 1.59
SYP-208ENST00000494396 CUL7Q14999 1698 aa24.96■■□□□ 1.59
SYP-208ENST00000494396 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
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