RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458677.1

ABCA9-AS1-201, ABCA9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ABCA9-AS1, Length 523 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.89■□□□□ 0.77
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.01■□□□□ 0.47
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.45■□□□□ 0.38
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ABCC9O60706 1549 aa16.82■□□□□ 0.28
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.71■□□□□ 0.27
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.37■□□□□ 0.21
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NACADO15069 1562 aa16.31■□□□□ 0.2
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.27■□□□□ 0.2
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.24■□□□□ 0.19
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.22■□□□□ 0.19
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SCRIBQ14160 1630 aa16.12■□□□□ 0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.92■□□□□ 0.14
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.73■□□□□ 0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.5■□□□□ 0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.38■□□□□ 0.05
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SMARCA4P51532 1647 aa15.37■□□□□ 0.05
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 WIZO95785 1651 aa15.28■□□□□ 0.04
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.17■□□□□ 0.02
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SMARCA2P51531 1590 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.15■□□□□ 0.02
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.11■□□□□ 0.01
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NCAPD3P42695 1498 aa15.02■□□□□ -0
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 HMGXB3Q12766 1538 aa15.01□□□□□ -0.01
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.99□□□□□ -0.01
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 NESP48681 1621 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CFTRP13569 1480 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FOXD1Q16676 465 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PRDM2Q13029 1718 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ABCC8Q09428 1581 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TRIM41Q8WV44 630 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ERCC6Q03468 1493 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SYNJ1O43426 1573 aa14.43□□□□□ -0.1
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CUX1P39880 1505 aa14.4□□□□□ -0.1
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TOP2BQ02880 1626 aa14.37□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.36□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.36□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.35□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TOPBP1Q92547 1522 aa14.34□□□□□ -0.11
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.31□□□□□ -0.12
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 WDR62O43379 1518 aa14.25□□□□□ -0.13
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.24□□□□□ -0.13
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SOGA1O94964 1423 aa14.24□□□□□ -0.13
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.23□□□□□ -0.13
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.2□□□□□ -0.14
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CUX2O14529 1486 aa14.19□□□□□ -0.14
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KIF27Q86VH2 1401 aa14.15□□□□□ -0.14
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 IFT140Q96RY7 1462 aa14.13□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.12□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.12□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 EEA1Q15075 1411 aa14.12□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 WDR97A6NE52 1622 aa14.11□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.09□□□□□ -0.15
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.07□□□□□ -0.16
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.06□□□□□ -0.16
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.04□□□□□ -0.16
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PBRM1Q86U86 1689 aa14.02□□□□□ -0.16
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 IGF1RP08069 1367 aa14□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ADRA2BP18089 450 aa13.99□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GRIN2BQ13224 1484 aa13.98□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.97□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 GOLGA3Q08378 1498 aa13.97□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 KIF21BO75037 1637 aa13.97□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.96□□□□□ -0.17
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.95□□□□□ -0.18
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 CUL7Q14999 1698 aa13.95□□□□□ -0.18
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.94□□□□□ -0.18
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 FBLN2P98095 1184 aa13.94□□□□□ -0.18
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 PRXQ9BXM0 1461 aa13.93□□□□□ -0.18
ABCA9-AS1-201ENST00000458677 ADAMTS12P58397 1594 aa13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms