RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.48■■□□□ 1.19
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXD1Q16676 465 aa19.7■□□□□ 0.74
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.56■□□□□ 0.56
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NACADO15069 1562 aa18.5■□□□□ 0.55
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.41■□□□□ 0.54
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.93■□□□□ 0.46
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.4■□□□□ 0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMARCA4P51532 1647 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.31■□□□□ 0.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMARCA2P51531 1590 aa17.18■□□□□ 0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.17■□□□□ 0.34
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.07■□□□□ 0.32
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NCAPD3P42695 1498 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMGXB3Q12766 1538 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.72■□□□□ 0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.7■□□□□ 0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFTRP13569 1480 aa16.57■□□□□ 0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.56■□□□□ 0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRDM2Q13029 1718 aa16.55■□□□□ 0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.54■□□□□ 0.24
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NESP48681 1621 aa16.41■□□□□ 0.22
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCC8Q09428 1581 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.29■□□□□ 0.2
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOP2BQ02880 1626 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.26■□□□□ 0.19
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERCC6Q03468 1493 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYNJ1O43426 1573 aa16.24■□□□□ 0.19
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CUX1P39880 1505 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.17■□□□□ 0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOPBP1Q92547 1522 aa16.17■□□□□ 0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR62O43379 1518 aa16.11■□□□□ 0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.1■□□□□ 0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EEA1Q15075 1411 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SOGA1O94964 1423 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF27Q86VH2 1401 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.98■□□□□ 0.15
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CUX2O14529 1486 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR97A6NE52 1622 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.89■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF39Q9H2S5 420 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF21BO75037 1637 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CUL7Q14999 1698 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PBRM1Q86U86 1689 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GRIN2BQ13224 1484 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGF1RP08069 1367 aa15.78■□□□□ 0.12
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