RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075805.12

Prrx1-202, Transcript of Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrx1, Length 4,986 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Rhox8Q6VSS7 320 aa26.46■■□□□ 1.83
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Trim41Q5NCC3 630 aa23.49■■□□□ 1.35
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Cngb1E1AZ71 1325 aa23.45■■□□□ 1.34
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.44■■□□□ 1.34
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Wdr66E9Q743 1299 aa22.94■■□□□ 1.26
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Npm2Q80W85 207 aa22.85■■□□□ 1.25
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Zeb1Q64318 1117 aa22.76■■□□□ 1.23
Prrx1-202ENSMUST00000075805 HrcG5E8J6 738 aa22.75■■□□□ 1.23
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Baz1aO88379 1555 aa20.76■□□□□ 0.91
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Chic1Q8CBW7 227 aa20.72■□□□□ 0.91
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.66■□□□□ 0.9
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.62■□□□□ 0.89
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 DaxxO35613 739 aa20.22■□□□□ 0.83
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Atp1b4Q99ME6 356 aa20.19■□□□□ 0.82
Prrx1-202ENSMUST00000075805 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.14■□□□□ 0.81
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Prrx1-202ENSMUST00000075805 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.12■□□□□ 0.81
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