Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.34■■■■■ 7.89
Chic1Q8CBW7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.52■■■■■ 7.12
Chic1Q8CBW7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.51■■■■■ 6.96
Chic1Q8CBW7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC56.13■■■■■ 6.58
Chic1Q8CBW7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC55.9■■■■■ 6.54
Chic1Q8CBW7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.48■■■■■ 6.47
Chic1Q8CBW7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC55.07■■■■■ 6.41
Chic1Q8CBW7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
Chic1Q8CBW7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.32■■■■■ 6.29
Chic1Q8CBW7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
Chic1Q8CBW7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
Chic1Q8CBW7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.6■■■■■ 6.17
Chic1Q8CBW7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.58■■■■■ 6.17
Chic1Q8CBW7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
Chic1Q8CBW7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
Chic1Q8CBW7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
Chic1Q8CBW7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52.09■■■■■ 5.93
Chic1Q8CBW7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.04■■■■■ 5.92
Chic1Q8CBW7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
Chic1Q8CBW7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC51.8■■■■■ 5.88
Chic1Q8CBW7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.78■■■■■ 5.88
Chic1Q8CBW7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
Chic1Q8CBW7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
Chic1Q8CBW7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
Chic1Q8CBW7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
Chic1Q8CBW7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
Chic1Q8CBW7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
Chic1Q8CBW7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
Chic1Q8CBW7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.77
Chic1Q8CBW7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC51.11■■■■■ 5.77
Chic1Q8CBW7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
Chic1Q8CBW7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51.02■■■■■ 5.76
Chic1Q8CBW7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
Chic1Q8CBW7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
Chic1Q8CBW7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Chic1Q8CBW7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
Chic1Q8CBW7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
Chic1Q8CBW7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC49.98■■■■■ 5.59
Chic1Q8CBW7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
Chic1Q8CBW7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
Chic1Q8CBW7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
Chic1Q8CBW7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
Chic1Q8CBW7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
Chic1Q8CBW7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC49.47■■■■■ 5.51
Chic1Q8CBW7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
Chic1Q8CBW7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
Chic1Q8CBW7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC49.25■■■■■ 5.47
Chic1Q8CBW7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Chic1Q8CBW7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
Chic1Q8CBW7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
Chic1Q8CBW7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
Chic1Q8CBW7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.43
Chic1Q8CBW7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC48.89■■■■■ 5.42
Chic1Q8CBW7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.79■■■■■ 5.4
Chic1Q8CBW7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Chic1Q8CBW7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
Chic1Q8CBW7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
Chic1Q8CBW7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Chic1Q8CBW7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Chic1Q8CBW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
Chic1Q8CBW7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Chic1Q8CBW7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Chic1Q8CBW7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
Chic1Q8CBW7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
Chic1Q8CBW7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Chic1Q8CBW7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Chic1Q8CBW7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.94■■■■■ 5.26
Chic1Q8CBW7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC47.94■■■■■ 5.26
Chic1Q8CBW7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
Chic1Q8CBW7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Chic1Q8CBW7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
Chic1Q8CBW7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
Chic1Q8CBW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
Chic1Q8CBW7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Chic1Q8CBW7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Chic1Q8CBW7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Chic1Q8CBW7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Chic1Q8CBW7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47.7■■■■■ 5.23
Chic1Q8CBW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Chic1Q8CBW7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Chic1Q8CBW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47.61■■■■■ 5.21
Chic1Q8CBW7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Chic1Q8CBW7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Chic1Q8CBW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Chic1Q8CBW7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Chic1Q8CBW7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Chic1Q8CBW7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
Chic1Q8CBW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
Chic1Q8CBW7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Chic1Q8CBW7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
Chic1Q8CBW7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
Chic1Q8CBW7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Chic1Q8CBW7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47.26■■■■■ 5.16
Chic1Q8CBW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
Chic1Q8CBW7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Chic1Q8CBW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Chic1Q8CBW7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
Chic1Q8CBW7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Chic1Q8CBW7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Chic1Q8CBW7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms