Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC64.11■■■■■ 7.85
Ttbk1Q6PCN3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC60.03■■■■■ 7.2
Ttbk1Q6PCN3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.99■■■■■ 7.03
Ttbk1Q6PCN3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC56.45■■■■■ 6.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.56■■■■■ 6.32
Ttbk1Q6PCN3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
Ttbk1Q6PCN3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.27
Ttbk1Q6PCN3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
Ttbk1Q6PCN3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
Ttbk1Q6PCN3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53.34■■■■■ 6.13
Ttbk1Q6PCN3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC53.11■■■■■ 6.09
Ttbk1Q6PCN3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.02■■■■■ 6.08
Ttbk1Q6PCN3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
Ttbk1Q6PCN3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.72■■■■■ 6.03
Ttbk1Q6PCN3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
Ttbk1Q6PCN3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC52.32■■■■■ 5.97
Ttbk1Q6PCN3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
Ttbk1Q6PCN3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
Ttbk1Q6PCN3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC51.05■■■■■ 5.76
Ttbk1Q6PCN3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
Ttbk1Q6PCN3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
Ttbk1Q6PCN3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.65■■■■■ 5.7
Ttbk1Q6PCN3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
Ttbk1Q6PCN3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.94■■■■■ 5.59
Ttbk1Q6PCN3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
Ttbk1Q6PCN3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC49.72■■■■■ 5.55
Ttbk1Q6PCN3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.66■■■■■ 5.54
Ttbk1Q6PCN3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC49.12■■■■■ 5.45
Ttbk1Q6PCN3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC49.12■■■■■ 5.45
Ttbk1Q6PCN3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
Ttbk1Q6PCN3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC49.04■■■■■ 5.44
Ttbk1Q6PCN3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.81■■■■■ 5.4
Ttbk1Q6PCN3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
Ttbk1Q6PCN3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.66■■■■■ 5.38
Ttbk1Q6PCN3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Ttbk1Q6PCN3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Ttbk1Q6PCN3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Ttbk1Q6PCN3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Ttbk1Q6PCN3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Ttbk1Q6PCN3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Ttbk1Q6PCN3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
Ttbk1Q6PCN3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Ttbk1Q6PCN3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
Ttbk1Q6PCN3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
Ttbk1Q6PCN3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Ttbk1Q6PCN3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
Ttbk1Q6PCN3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Ttbk1Q6PCN3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Ttbk1Q6PCN3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
Ttbk1Q6PCN3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
Ttbk1Q6PCN3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Ttbk1Q6PCN3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Ttbk1Q6PCN3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Ttbk1Q6PCN3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
Ttbk1Q6PCN3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
Ttbk1Q6PCN3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
Ttbk1Q6PCN3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.82■■■■■ 5.09
Ttbk1Q6PCN3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
Ttbk1Q6PCN3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Ttbk1Q6PCN3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Ttbk1Q6PCN3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Ttbk1Q6PCN3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Ttbk1Q6PCN3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.38■■■■■ 5.02
Ttbk1Q6PCN3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
Ttbk1Q6PCN3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Ttbk1Q6PCN3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Ttbk1Q6PCN3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.26■■■■■ 5
Ttbk1Q6PCN3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
Ttbk1Q6PCN3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Ttbk1Q6PCN3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Ttbk1Q6PCN3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Ttbk1Q6PCN3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Ttbk1Q6PCN3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Ttbk1Q6PCN3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Ttbk1Q6PCN3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Ttbk1Q6PCN3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Ttbk1Q6PCN3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Ttbk1Q6PCN3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
Ttbk1Q6PCN3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Ttbk1Q6PCN3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Ttbk1Q6PCN3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
Ttbk1Q6PCN3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Ttbk1Q6PCN3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Ttbk1Q6PCN3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Ttbk1Q6PCN3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Ttbk1Q6PCN3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Ttbk1Q6PCN3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Ttbk1Q6PCN3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ttbk1Q6PCN3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
Ttbk1Q6PCN3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Ttbk1Q6PCN3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Ttbk1Q6PCN3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Ttbk1Q6PCN3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Ttbk1Q6PCN3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Ttbk1Q6PCN3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Ttbk1Q6PCN3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Ttbk1Q6PCN3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms