Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57.04■■■■■ 6.72
Clstn2Q9ER65 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
Clstn2Q9ER65 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
Clstn2Q9ER65 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49.8■■■■■ 5.56
Clstn2Q9ER65 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.44■■■■■ 5.51
Clstn2Q9ER65 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
Clstn2Q9ER65 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Clstn2Q9ER65 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Clstn2Q9ER65 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
Clstn2Q9ER65 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Clstn2Q9ER65 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.68■■■■■ 5.22
Clstn2Q9ER65 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Clstn2Q9ER65 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Clstn2Q9ER65 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Clstn2Q9ER65 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Clstn2Q9ER65 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
Clstn2Q9ER65 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Clstn2Q9ER65 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Clstn2Q9ER65 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Clstn2Q9ER65 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
Clstn2Q9ER65 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Clstn2Q9ER65 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Clstn2Q9ER65 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Clstn2Q9ER65 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Clstn2Q9ER65 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Clstn2Q9ER65 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Clstn2Q9ER65 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Clstn2Q9ER65 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Clstn2Q9ER65 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Clstn2Q9ER65 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Clstn2Q9ER65 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
Clstn2Q9ER65 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Clstn2Q9ER65 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Clstn2Q9ER65 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
Clstn2Q9ER65 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Clstn2Q9ER65 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Clstn2Q9ER65 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Clstn2Q9ER65 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Clstn2Q9ER65 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Clstn2Q9ER65 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Clstn2Q9ER65 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Clstn2Q9ER65 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Clstn2Q9ER65 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Clstn2Q9ER65 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Clstn2Q9ER65 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Clstn2Q9ER65 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Clstn2Q9ER65 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Clstn2Q9ER65 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Clstn2Q9ER65 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Clstn2Q9ER65 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Clstn2Q9ER65 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Clstn2Q9ER65 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Clstn2Q9ER65 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Clstn2Q9ER65 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
Clstn2Q9ER65 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Clstn2Q9ER65 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
Clstn2Q9ER65 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Clstn2Q9ER65 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Clstn2Q9ER65 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Clstn2Q9ER65 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Clstn2Q9ER65 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Clstn2Q9ER65 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Clstn2Q9ER65 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Clstn2Q9ER65 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Clstn2Q9ER65 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Clstn2Q9ER65 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Clstn2Q9ER65 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Clstn2Q9ER65 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Clstn2Q9ER65 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Clstn2Q9ER65 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Clstn2Q9ER65 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Clstn2Q9ER65 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Clstn2Q9ER65 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Clstn2Q9ER65 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Clstn2Q9ER65 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Clstn2Q9ER65 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Clstn2Q9ER65 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Clstn2Q9ER65 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Clstn2Q9ER65 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Clstn2Q9ER65 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Clstn2Q9ER65 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Clstn2Q9ER65 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Clstn2Q9ER65 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Clstn2Q9ER65 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Clstn2Q9ER65 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Clstn2Q9ER65 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
Clstn2Q9ER65 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Clstn2Q9ER65 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Clstn2Q9ER65 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Clstn2Q9ER65 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Clstn2Q9ER65 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Clstn2Q9ER65 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Clstn2Q9ER65 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Clstn2Q9ER65 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Clstn2Q9ER65 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Clstn2Q9ER65 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Clstn2Q9ER65 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Clstn2Q9ER65 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Clstn2Q9ER65 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Clstn2Q9ER65 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms