Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC69.06■■■■■ 8.65
Ccdc136Q3TVA9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC63.98■■■■■ 7.83
Ccdc136Q3TVA9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.96■■■■■ 7.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC60.06■■■■■ 7.21
Ccdc136Q3TVA9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC59.98■■■■■ 7.19
Ccdc136Q3TVA9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC58.79■■■■■ 7
Ccdc136Q3TVA9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.43■■■■■ 6.94
Ccdc136Q3TVA9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.33■■■■■ 6.93
Ccdc136Q3TVA9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.28■■■■■ 6.92
Ccdc136Q3TVA9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC57.82■■■■■ 6.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC57.54■■■■■ 6.8
Ccdc136Q3TVA9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
Ccdc136Q3TVA9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.29■■■■■ 6.76
Ccdc136Q3TVA9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.49■■■■■ 6.63
Ccdc136Q3TVA9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.13■■■■■ 6.58
Ccdc136Q3TVA9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC56.05■■■■■ 6.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC55.66■■■■■ 6.5
Ccdc136Q3TVA9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC55.51■■■■■ 6.48
Ccdc136Q3TVA9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
Ccdc136Q3TVA9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55.34■■■■■ 6.45
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
Ccdc136Q3TVA9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC55.26■■■■■ 6.44
Ccdc136Q3TVA9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
Ccdc136Q3TVA9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.08■■■■■ 6.41
Ccdc136Q3TVA9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC54.65■■■■■ 6.34
Ccdc136Q3TVA9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.65■■■■■ 6.34
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
Ccdc136Q3TVA9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.62■■■■■ 6.33
Ccdc136Q3TVA9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.59■■■■■ 6.33
Ccdc136Q3TVA9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.33
Ccdc136Q3TVA9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC54.45■■■■■ 6.31
Ccdc136Q3TVA9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC54.1■■■■■ 6.25
Ccdc136Q3TVA9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
Ccdc136Q3TVA9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC53.67■■■■■ 6.18
Ccdc136Q3TVA9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
Ccdc136Q3TVA9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.35■■■■■ 6.13
Ccdc136Q3TVA9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
Ccdc136Q3TVA9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
Ccdc136Q3TVA9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC53.04■■■■■ 6.08
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC53■■■■■ 6.07
Ccdc136Q3TVA9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.73■■■■■ 6.03
Ccdc136Q3TVA9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC52.69■■■■■ 6.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC52.63■■■■■ 6.02
Ccdc136Q3TVA9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
Ccdc136Q3TVA9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
Ccdc136Q3TVA9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC52.41■■■■■ 5.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC52.3■■■■■ 5.96
Ccdc136Q3TVA9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
Ccdc136Q3TVA9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.21■■■■■ 5.95
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
Ccdc136Q3TVA9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC51.91■■■■■ 5.9
Ccdc136Q3TVA9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC51.85■■■■■ 5.89
Ccdc136Q3TVA9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
Ccdc136Q3TVA9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Ccdc136Q3TVA9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC51.77■■■■■ 5.88
Ccdc136Q3TVA9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC51.76■■■■■ 5.88
Ccdc136Q3TVA9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
Ccdc136Q3TVA9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC51.63■■■■■ 5.86
Ccdc136Q3TVA9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.44■■■■■ 5.83
Ccdc136Q3TVA9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC51.39■■■■■ 5.82
Ccdc136Q3TVA9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
Ccdc136Q3TVA9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
Ccdc136Q3TVA9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
Ccdc136Q3TVA9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC51.29■■■■■ 5.8
Ccdc136Q3TVA9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC51.27■■■■■ 5.8
Ccdc136Q3TVA9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
Ccdc136Q3TVA9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.21■■■■■ 5.79
Ccdc136Q3TVA9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
Ccdc136Q3TVA9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC51.07■■■■■ 5.77
Ccdc136Q3TVA9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC51.06■■■■■ 5.76
Ccdc136Q3TVA9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
Ccdc136Q3TVA9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
Ccdc136Q3TVA9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
Ccdc136Q3TVA9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.73
Ccdc136Q3TVA9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
Ccdc136Q3TVA9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
Ccdc136Q3TVA9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
Ccdc136Q3TVA9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC50.76■■■■■ 5.72
Ccdc136Q3TVA9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
Ccdc136Q3TVA9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.59■■■■■ 5.69
Ccdc136Q3TVA9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
Ccdc136Q3TVA9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
Ccdc136Q3TVA9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC50.13■■■■■ 5.62
Ccdc136Q3TVA9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
Ccdc136Q3TVA9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC50.1■■■■■ 5.61
Ccdc136Q3TVA9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC50.07■■■■■ 5.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms