Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC66.85■■■■■ 8.29
Ccdc18Q640L5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC62.17■■■■■ 7.54
Ccdc18Q640L5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.08■■■■■ 7.37
Ccdc18Q640L5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC58.32■■■■■ 6.93
Ccdc18Q640L5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC57.86■■■■■ 6.85
Ccdc18Q640L5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC56.56■■■■■ 6.64
Ccdc18Q640L5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.53■■■■■ 6.64
Ccdc18Q640L5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.28■■■■■ 6.6
Ccdc18Q640L5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC56.26■■■■■ 6.6
Ccdc18Q640L5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC55.75■■■■■ 6.51
Ccdc18Q640L5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
Ccdc18Q640L5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC54.51■■■■■ 6.32
Ccdc18Q640L5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC54.02■■■■■ 6.24
Ccdc18Q640L5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC54■■■■■ 6.23
Ccdc18Q640L5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
Ccdc18Q640L5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
Ccdc18Q640L5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
Ccdc18Q640L5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
Ccdc18Q640L5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC53.41■■■■■ 6.14
Ccdc18Q640L5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
Ccdc18Q640L5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
Ccdc18Q640L5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
Ccdc18Q640L5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC53.02■■■■■ 6.08
Ccdc18Q640L5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC52.94■■■■■ 6.07
Ccdc18Q640L5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
Ccdc18Q640L5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.04■■■■■ 5.92
Ccdc18Q640L5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
Ccdc18Q640L5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.93■■■■■ 5.9
Ccdc18Q640L5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC51.87■■■■■ 5.89
Ccdc18Q640L5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Ccdc18Q640L5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
Ccdc18Q640L5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.52■■■■■ 5.84
Ccdc18Q640L5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.52■■■■■ 5.84
Ccdc18Q640L5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
Ccdc18Q640L5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
Ccdc18Q640L5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC51.28■■■■■ 5.8
Ccdc18Q640L5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC51.27■■■■■ 5.8
Ccdc18Q640L5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51.13■■■■■ 5.78
Ccdc18Q640L5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
Ccdc18Q640L5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
Ccdc18Q640L5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
Ccdc18Q640L5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC50.56■■■■■ 5.68
Ccdc18Q640L5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC50.43■■■■■ 5.66
Ccdc18Q640L5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
Ccdc18Q640L5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
Ccdc18Q640L5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
Ccdc18Q640L5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC50.09■■■■■ 5.61
Ccdc18Q640L5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.08■■■■■ 5.61
Ccdc18Q640L5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
Ccdc18Q640L5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
Ccdc18Q640L5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC49.99■■■■■ 5.59
Ccdc18Q640L5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC49.97■■■■■ 5.59
Ccdc18Q640L5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
Ccdc18Q640L5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
Ccdc18Q640L5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
Ccdc18Q640L5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC49.69■■■■■ 5.54
Ccdc18Q640L5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
Ccdc18Q640L5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
Ccdc18Q640L5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
Ccdc18Q640L5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
Ccdc18Q640L5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC49.44■■■■■ 5.5
Ccdc18Q640L5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
Ccdc18Q640L5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC49.27■■■■■ 5.48
Ccdc18Q640L5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC49.07■■■■■ 5.45
Ccdc18Q640L5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC49■■■■■ 5.43
Ccdc18Q640L5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
Ccdc18Q640L5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
Ccdc18Q640L5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
Ccdc18Q640L5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
Ccdc18Q640L5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
Ccdc18Q640L5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
Ccdc18Q640L5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Ccdc18Q640L5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
Ccdc18Q640L5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Ccdc18Q640L5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Ccdc18Q640L5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
Ccdc18Q640L5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC48.52■■■■■ 5.36
Ccdc18Q640L5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Ccdc18Q640L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
Ccdc18Q640L5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
Ccdc18Q640L5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Ccdc18Q640L5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC48.19■■■■■ 5.31
Ccdc18Q640L5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
Ccdc18Q640L5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Ccdc18Q640L5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
Ccdc18Q640L5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Ccdc18Q640L5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
Ccdc18Q640L5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
Ccdc18Q640L5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Ccdc18Q640L5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
Ccdc18Q640L5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Ccdc18Q640L5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Ccdc18Q640L5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC47.8■■■■■ 5.24
Ccdc18Q640L5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
Ccdc18Q640L5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
Ccdc18Q640L5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.75■■■■■ 5.23
Ccdc18Q640L5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Ccdc18Q640L5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
Ccdc18Q640L5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms