Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61,05■■■■■ 7,36
Setd5Q5XJV7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56,48■■■■■ 6,63
Setd5Q5XJV7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,57■■■■■ 6,49
Setd5Q5XJV7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53,3■■■■■ 6,12
Setd5Q5XJV7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53■■■■■ 6,08
Setd5Q5XJV7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52,22■■■■■ 5,95
Setd5Q5XJV7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,15■■■■■ 5,94
Setd5Q5XJV7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,63■■■■■ 5,86
Setd5Q5XJV7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51,54■■■■■ 5,84
Setd5Q5XJV7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,24■■■■■ 5,79
Setd5Q5XJV7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51,06■■■■■ 5,76
Setd5Q5XJV7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50,92■■■■■ 5,74
Setd5Q5XJV7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,7■■■■■ 5,71
Setd5Q5XJV7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50,44■■■■■ 5,66
Setd5Q5XJV7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,71■■■■■ 5,55
Setd5Q5XJV7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,4■■■■■ 5,5
Setd5Q5XJV7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49,34■■■■■ 5,49
Setd5Q5XJV7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49,2■■■■■ 5,47
Setd5Q5XJV7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49,14■■■■■ 5,46
Setd5Q5XJV7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,13■■■■■ 5,46
Setd5Q5XJV7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49,06■■■■■ 5,44
Setd5Q5XJV7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,9■■■■■ 5,42
Setd5Q5XJV7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,76■■■■■ 5,4
Setd5Q5XJV7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,63■■■■■ 5,38
Setd5Q5XJV7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,55■■■■■ 5,36
Setd5Q5XJV7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,52■■■■■ 5,36
Setd5Q5XJV7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48,48■■■■■ 5,35
Setd5Q5XJV7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,41■■■■■ 5,34
Setd5Q5XJV7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,34■■■■■ 5,33
Setd5Q5XJV7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,31■■■■■ 5,32
Setd5Q5XJV7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48,25■■■■■ 5,31
Setd5Q5XJV7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48,22■■■■■ 5,31
Setd5Q5XJV7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,12■■■■■ 5,29
Setd5Q5XJV7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48,1■■■■■ 5,29
Setd5Q5XJV7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,01■■■■■ 5,28
Setd5Q5XJV7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47,94■■■■■ 5,26
Setd5Q5XJV7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,77■■■■■ 5,24
Setd5Q5XJV7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47,26■■■■■ 5,16
Setd5Q5XJV7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47,26■■■■■ 5,16
Setd5Q5XJV7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46,97■■■■■ 5,11
Setd5Q5XJV7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,97■■■■■ 5,11
Setd5Q5XJV7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46,88■■■■■ 5,1
Setd5Q5XJV7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,81■■■■■ 5,08
Setd5Q5XJV7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46,71■■■■■ 5,07
Setd5Q5XJV7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46,67■■■■■ 5,06
Setd5Q5XJV7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,67■■■■■ 5,06
Setd5Q5XJV7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,66■■■■■ 5,06
Setd5Q5XJV7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,64■■■■■ 5,06
Setd5Q5XJV7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,56■■■■■ 5,04
Setd5Q5XJV7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46,37■■■■■ 5,01
Setd5Q5XJV7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46,35■■■■■ 5,01
Setd5Q5XJV7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,19■■■■■ 4,98
Setd5Q5XJV7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,17■■■■■ 4,98
Setd5Q5XJV7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46,09■■■■■ 4,97
Setd5Q5XJV7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46,09■■■■■ 4,97
Setd5Q5XJV7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45,97■■■■■ 4,95
Setd5Q5XJV7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,96■■■■■ 4,95
Setd5Q5XJV7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,9■■■■■ 4,94
Setd5Q5XJV7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45,87■■■■■ 4,93
Setd5Q5XJV7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,81■■■■■ 4,92
Setd5Q5XJV7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45,71■■■■■ 4,91
Setd5Q5XJV7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45,59■■■■■ 4,89
Setd5Q5XJV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,56■■■■■ 4,88
Setd5Q5XJV7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,55■■■■■ 4,88
Setd5Q5XJV7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45,46■■■■■ 4,87
Setd5Q5XJV7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45,42■■■■■ 4,86
Setd5Q5XJV7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,38■■■■■ 4,85
Setd5Q5XJV7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45,36■■■■■ 4,85
Setd5Q5XJV7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC45,36■■■■■ 4,85
Setd5Q5XJV7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,36■■■■■ 4,85
Setd5Q5XJV7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45,35■■■■■ 4,85
Setd5Q5XJV7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,34■■■■■ 4,85
Setd5Q5XJV7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45,3■■■■■ 4,84
Setd5Q5XJV7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,25■■■■■ 4,83
Setd5Q5XJV7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45,24■■■■■ 4,83
Setd5Q5XJV7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,21■■■■■ 4,83
Setd5Q5XJV7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45,17■■■■■ 4,82
Setd5Q5XJV7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,09■■■■■ 4,81
Setd5Q5XJV7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,08■■■■■ 4,81
Setd5Q5XJV7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,03■■■■■ 4,8
Setd5Q5XJV7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Setd5Q5XJV7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Setd5Q5XJV7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,94■■■■■ 4,79
Setd5Q5XJV7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44,94■■■■■ 4,79
Setd5Q5XJV7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44,93■■■■■ 4,78
Setd5Q5XJV7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,84■■■■■ 4,77
Setd5Q5XJV7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44,83■■■■■ 4,77
Setd5Q5XJV7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,82■■■■■ 4,77
Setd5Q5XJV7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,82■■■■■ 4,76
Setd5Q5XJV7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44,78■■■■■ 4,76
Setd5Q5XJV7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,75■■■■■ 4,75
Setd5Q5XJV7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44,74■■■■■ 4,75
Setd5Q5XJV7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,69■■■■■ 4,75
Setd5Q5XJV7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44,67■■■■■ 4,74
Setd5Q5XJV7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44,62■■■■■ 4,73
Setd5Q5XJV7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44,58■■■■■ 4,73
Setd5Q5XJV7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,53■■■■■ 4,72
Setd5Q5XJV7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,49■■■■■ 4,71
Setd5Q5XJV7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44,47■■■■■ 4,71
Setd5Q5XJV7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44,42■■■■■ 4,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,1 ms