Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC77,88■■■■■ 10,06
Kdm5dQ62240 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC72,61■■■■■ 9,21
Kdm5dQ62240 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71,04■■■■■ 8,96
Kdm5dQ62240 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC68,21■■■■■ 8,51
Kdm5dQ62240 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC67,14■■■■■ 8,34
Kdm5dQ62240 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC65,87■■■■■ 8,13
Kdm5dQ62240 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC65,76■■■■■ 8,12
Kdm5dQ62240 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65,43■■■■■ 8,06
Kdm5dQ62240 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC65,31■■■■■ 8,05
Kdm5dQ62240 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65,25■■■■■ 8,04
Kdm5dQ62240 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC64,78■■■■■ 7,96
Kdm5dQ62240 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC63,74■■■■■ 7,79
Kdm5dQ62240 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC63,16■■■■■ 7,7
Kdm5dQ62240 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63,16■■■■■ 7,7
Kdm5dQ62240 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC63,07■■■■■ 7,69
Kdm5dQ62240 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62,65■■■■■ 7,62
Kdm5dQ62240 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62,54■■■■■ 7,6
Kdm5dQ62240 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62,09■■■■■ 7,53
Kdm5dQ62240 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC61,86■■■■■ 7,49
Kdm5dQ62240 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61,81■■■■■ 7,49
Kdm5dQ62240 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC61,8■■■■■ 7,48
Kdm5dQ62240 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC61,71■■■■■ 7,47
Kdm5dQ62240 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61,26■■■■■ 7,4
Kdm5dQ62240 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60,72■■■■■ 7,31
Kdm5dQ62240 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60,61■■■■■ 7,29
Kdm5dQ62240 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60,51■■■■■ 7,28
Kdm5dQ62240 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC60,36■■■■■ 7,25
Kdm5dQ62240 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60,06■■■■■ 7,2
Kdm5dQ62240 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60■■■■■ 7,2
Kdm5dQ62240 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59,72■■■■■ 7,15
Kdm5dQ62240 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC59,68■■■■■ 7,14
Kdm5dQ62240 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC59,62■■■■■ 7,13
Kdm5dQ62240 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC59,57■■■■■ 7,13
Kdm5dQ62240 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC59,43■■■■■ 7,1
Kdm5dQ62240 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59,36■■■■■ 7,09
Kdm5dQ62240 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59,3■■■■■ 7,08
Kdm5dQ62240 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59,25■■■■■ 7,08
Kdm5dQ62240 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59,04■■■■■ 7,04
Kdm5dQ62240 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC58,95■■■■■ 7,03
Kdm5dQ62240 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC58,86■■■■■ 7,01
Kdm5dQ62240 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58,85■■■■■ 7,01
Kdm5dQ62240 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC58,76■■■■■ 7
Kdm5dQ62240 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC58,66■■■■■ 6,98
Kdm5dQ62240 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58,65■■■■■ 6,98
Kdm5dQ62240 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC58,62■■■■■ 6,97
Kdm5dQ62240 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58,57■■■■■ 6,97
Kdm5dQ62240 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC58,37■■■■■ 6,93
Kdm5dQ62240 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC58,31■■■■■ 6,92
Kdm5dQ62240 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC58,18■■■■■ 6,9
Kdm5dQ62240 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC58,15■■■■■ 6,9
Kdm5dQ62240 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC58,05■■■■■ 6,88
Kdm5dQ62240 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC57,95■■■■■ 6,87
Kdm5dQ62240 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57,87■■■■■ 6,85
Kdm5dQ62240 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57,85■■■■■ 6,85
Kdm5dQ62240 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC57,81■■■■■ 6,84
Kdm5dQ62240 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC57,74■■■■■ 6,83
Kdm5dQ62240 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC57,71■■■■■ 6,83
Kdm5dQ62240 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57,7■■■■■ 6,83
Kdm5dQ62240 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57,42■■■■■ 6,78
Kdm5dQ62240 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57,3■■■■■ 6,76
Kdm5dQ62240 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC57,25■■■■■ 6,75
Kdm5dQ62240 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC57,21■■■■■ 6,75
Kdm5dQ62240 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57,16■■■■■ 6,74
Kdm5dQ62240 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC57,11■■■■■ 6,73
Kdm5dQ62240 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57,03■■■■■ 6,72
Kdm5dQ62240 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC56,96■■■■■ 6,71
Kdm5dQ62240 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC56,89■■■■■ 6,7
Kdm5dQ62240 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC56,6■■■■■ 6,65
Kdm5dQ62240 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56,59■■■■■ 6,65
Kdm5dQ62240 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC56,58■■■■■ 6,65
Kdm5dQ62240 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC56,55■■■■■ 6,64
Kdm5dQ62240 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,49■■■■■ 6,63
Kdm5dQ62240 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56,42■■■■■ 6,62
Kdm5dQ62240 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,36■■■■■ 6,61
Kdm5dQ62240 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56,31■■■■■ 6,6
Kdm5dQ62240 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,29■■■■■ 6,6
Kdm5dQ62240 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56,21■■■■■ 6,59
Kdm5dQ62240 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC56,19■■■■■ 6,59
Kdm5dQ62240 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,13■■■■■ 6,58
Kdm5dQ62240 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC56,13■■■■■ 6,58
Kdm5dQ62240 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC56,04■■■■■ 6,56
Kdm5dQ62240 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC55,9■■■■■ 6,54
Kdm5dQ62240 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC55,82■■■■■ 6,53
Kdm5dQ62240 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55,78■■■■■ 6,52
Kdm5dQ62240 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC55,76■■■■■ 6,52
Kdm5dQ62240 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC55,7■■■■■ 6,51
Kdm5dQ62240 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55,6■■■■■ 6,49
Kdm5dQ62240 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC55,56■■■■■ 6,48
Kdm5dQ62240 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,56■■■■■ 6,48
Kdm5dQ62240 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC55,55■■■■■ 6,48
Kdm5dQ62240 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55,47■■■■■ 6,47
Kdm5dQ62240 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55,46■■■■■ 6,47
Kdm5dQ62240 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55,44■■■■■ 6,47
Kdm5dQ62240 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,42■■■■■ 6,46
Kdm5dQ62240 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,41■■■■■ 6,46
Kdm5dQ62240 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC55,4■■■■■ 6,46
Kdm5dQ62240 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,37■■■■■ 6,45
Kdm5dQ62240 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC55,28■■■■■ 6,44
Kdm5dQ62240 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55,25■■■■■ 6,43
Kdm5dQ62240 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC55,24■■■■■ 6,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,8 ms