Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G3

Chic2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic2Q9D9G3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57.98■■■■■ 6.87
Chic2Q9D9G3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53.67■■■■■ 6.18
Chic2Q9D9G3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
Chic2Q9D9G3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.55■■■■■ 5.68
Chic2Q9D9G3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
Chic2Q9D9G3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
Chic2Q9D9G3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.5■■■■■ 5.51
Chic2Q9D9G3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
Chic2Q9D9G3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
Chic2Q9D9G3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
Chic2Q9D9G3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
Chic2Q9D9G3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
Chic2Q9D9G3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Chic2Q9D9G3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
Chic2Q9D9G3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
Chic2Q9D9G3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Chic2Q9D9G3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
Chic2Q9D9G3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
Chic2Q9D9G3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Chic2Q9D9G3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Chic2Q9D9G3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46.66■■■■■ 5.06
Chic2Q9D9G3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Chic2Q9D9G3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Chic2Q9D9G3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Chic2Q9D9G3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Chic2Q9D9G3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Chic2Q9D9G3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Chic2Q9D9G3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Chic2Q9D9G3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Chic2Q9D9G3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
Chic2Q9D9G3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Chic2Q9D9G3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
Chic2Q9D9G3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
Chic2Q9D9G3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Chic2Q9D9G3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Chic2Q9D9G3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
Chic2Q9D9G3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Chic2Q9D9G3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Chic2Q9D9G3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Chic2Q9D9G3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Chic2Q9D9G3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Chic2Q9D9G3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Chic2Q9D9G3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Chic2Q9D9G3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Chic2Q9D9G3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Chic2Q9D9G3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Chic2Q9D9G3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Chic2Q9D9G3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Chic2Q9D9G3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Chic2Q9D9G3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Chic2Q9D9G3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Chic2Q9D9G3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Chic2Q9D9G3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Chic2Q9D9G3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Chic2Q9D9G3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
Chic2Q9D9G3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Chic2Q9D9G3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Chic2Q9D9G3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Chic2Q9D9G3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Chic2Q9D9G3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
Chic2Q9D9G3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Chic2Q9D9G3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Chic2Q9D9G3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Chic2Q9D9G3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Chic2Q9D9G3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Chic2Q9D9G3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Chic2Q9D9G3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Chic2Q9D9G3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Chic2Q9D9G3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Chic2Q9D9G3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Chic2Q9D9G3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Chic2Q9D9G3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Chic2Q9D9G3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Chic2Q9D9G3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Chic2Q9D9G3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
Chic2Q9D9G3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Chic2Q9D9G3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Chic2Q9D9G3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Chic2Q9D9G3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Chic2Q9D9G3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Chic2Q9D9G3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Chic2Q9D9G3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Chic2Q9D9G3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Chic2Q9D9G3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Chic2Q9D9G3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Chic2Q9D9G3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
Chic2Q9D9G3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Chic2Q9D9G3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Chic2Q9D9G3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chic2Q9D9G3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
Chic2Q9D9G3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Chic2Q9D9G3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Chic2Q9D9G3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Chic2Q9D9G3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Chic2Q9D9G3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Chic2Q9D9G3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Chic2Q9D9G3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Chic2Q9D9G3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Chic2Q9D9G3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Chic2Q9D9G3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms