Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60,16■■■■■ 7,22
Lmod2Q3UHZ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55,75■■■■■ 6,52
Lmod2Q3UHZ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,84■■■■■ 6,37
Lmod2Q3UHZ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52,33■■■■■ 5,97
Lmod2Q3UHZ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52,24■■■■■ 5,95
Lmod2Q3UHZ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51,21■■■■■ 5,79
Lmod2Q3UHZ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,9■■■■■ 5,74
Lmod2Q3UHZ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,81■■■■■ 5,73
Lmod2Q3UHZ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,76■■■■■ 5,72
Lmod2Q3UHZ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50,38■■■■■ 5,66
Lmod2Q3UHZ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50,12■■■■■ 5,61
Lmod2Q3UHZ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,03■■■■■ 5,6
Lmod2Q3UHZ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,93■■■■■ 5,58
Lmod2Q3UHZ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,18■■■■■ 5,46
Lmod2Q3UHZ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,85■■■■■ 5,41
Lmod2Q3UHZ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC48,83■■■■■ 5,41
Lmod2Q3UHZ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48,51■■■■■ 5,36
Lmod2Q3UHZ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48,32■■■■■ 5,33
Lmod2Q3UHZ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,27■■■■■ 5,32
Lmod2Q3UHZ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,23■■■■■ 5,31
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,16■■■■■ 5,3
Lmod2Q3UHZ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC48,12■■■■■ 5,29
Lmod2Q3UHZ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,05■■■■■ 5,28
Lmod2Q3UHZ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,96■■■■■ 5,27
Lmod2Q3UHZ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,77■■■■■ 5,24
Lmod2Q3UHZ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47,6■■■■■ 5,21
Lmod2Q3UHZ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,6■■■■■ 5,21
Lmod2Q3UHZ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,59■■■■■ 5,21
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,57■■■■■ 5,21
Lmod2Q3UHZ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47,55■■■■■ 5,2
Lmod2Q3UHZ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,52■■■■■ 5,2
Lmod2Q3UHZ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47,41■■■■■ 5,18
Lmod2Q3UHZ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC47,1■■■■■ 5,13
Lmod2Q3UHZ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,06■■■■■ 5,12
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,03■■■■■ 5,12
Lmod2Q3UHZ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46,71■■■■■ 5,07
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,65■■■■■ 5,06
Lmod2Q3UHZ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46,46■■■■■ 5,03
Lmod2Q3UHZ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46,25■■■■■ 4,99
Lmod2Q3UHZ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46,2■■■■■ 4,99
Lmod2Q3UHZ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,19■■■■■ 4,98
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC46,14■■■■■ 4,98
Lmod2Q3UHZ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,89■■■■■ 4,94
Lmod2Q3UHZ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45,87■■■■■ 4,93
Lmod2Q3UHZ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45,84■■■■■ 4,93
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,83■■■■■ 4,93
Lmod2Q3UHZ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,78■■■■■ 4,92
Lmod2Q3UHZ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45,63■■■■■ 4,9
Lmod2Q3UHZ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45,55■■■■■ 4,88
Lmod2Q3UHZ5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,45■■■■■ 4,87
Lmod2Q3UHZ5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,45■■■■■ 4,87
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,28■■■■■ 4,84
Lmod2Q3UHZ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC45,2■■■■■ 4,83
Lmod2Q3UHZ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,15■■■■■ 4,82
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45,15■■■■■ 4,82
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45,09■■■■■ 4,81
Lmod2Q3UHZ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,09■■■■■ 4,81
Lmod2Q3UHZ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45,08■■■■■ 4,81
Lmod2Q3UHZ5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4,79
Lmod2Q3UHZ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44,98■■■■■ 4,79
Lmod2Q3UHZ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,81■■■■■ 4,76
Lmod2Q3UHZ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44,76■■■■■ 4,76
Lmod2Q3UHZ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,74■■■■■ 4,75
Lmod2Q3UHZ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC44,74■■■■■ 4,75
Lmod2Q3UHZ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC44,73■■■■■ 4,75
Lmod2Q3UHZ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44,67■■■■■ 4,74
Lmod2Q3UHZ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44,65■■■■■ 4,74
Lmod2Q3UHZ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,61■■■■■ 4,73
Lmod2Q3UHZ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44,61■■■■■ 4,73
Lmod2Q3UHZ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,59■■■■■ 4,73
Lmod2Q3UHZ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
Lmod2Q3UHZ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44,48■■■■■ 4,71
Lmod2Q3UHZ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44,46■■■■■ 4,71
Lmod2Q3UHZ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,35■■■■■ 4,69
Lmod2Q3UHZ5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,33■■■■■ 4,69
Lmod2Q3UHZ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44,33■■■■■ 4,69
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,3■■■■■ 4,68
Lmod2Q3UHZ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,3■■■■■ 4,68
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,25■■■■■ 4,67
Lmod2Q3UHZ5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,21■■■■■ 4,67
Lmod2Q3UHZ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44,21■■■■■ 4,67
Lmod2Q3UHZ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44,2■■■■■ 4,67
Lmod2Q3UHZ5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,2■■■■■ 4,67
Lmod2Q3UHZ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
Lmod2Q3UHZ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44,1■■■■■ 4,65
Lmod2Q3UHZ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43,99■■■■■ 4,63
Lmod2Q3UHZ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,97■■■■■ 4,63
Lmod2Q3UHZ5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,62
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,62
Lmod2Q3UHZ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43,94■■■■■ 4,62
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,62
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Lmod2Q3UHZ5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Lmod2Q3UHZ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43,81■■■■■ 4,6
Lmod2Q3UHZ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Lmod2Q3UHZ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43,66■■■■■ 4,58
Lmod2Q3UHZ5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43,64■■■■■ 4,58
Lmod2Q3UHZ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43,64■■■■■ 4,58
Lmod2Q3UHZ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43,62■■■■■ 4,57
Lmod2Q3UHZ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43,6■■■■■ 4,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms